Разные люди проводят свои вечера в одном необычном кафе. Две девочки сплетничают, двое мужчин что-то обсуждают, мальчик читает книгу, парень только что расстался со своей подругой. Официантка кафе начинает разговор с ним и просит его взглянуть на картину в кафе, а в это время другие клиенты начинают замечать необычные вещи....

Когда существа из двумерного мира обнаруживают существование нашей вселенной, они решают послать двух красивых двумерных девушек в наш мир, чтобы подготовить его к полной интеграции. Однако, как только Компайлер и Ассемблер освободились от своего плоского и тоскливого 2-D существования, быстро обнаружили, что проводить время с парой 3-D парней намного веселее, чем завоевывать мир. Теперь, ради своих парней Ассемблер и Компайлер должны защитить Землю от своих бывших хозяев и армии программ-убийц....

Хинария — безработная, всё, чем она занимается, так это играет целыми днями. Однажды она решает взломать сервера, принадлежащие «Beholder Group», с целью немного подзаработать, и натыкается на тщательно защищённую запись о двух ведьмах, Алисе и Риммель. Две девушки просто хотят сосуществовать с человечеством, и история, с которой они столкнулись, связана с современным миром Зенонзард....

...

Где-то в будущем, в сумерках цивилизации, на краю одного острова стоит кофейня. Заправляет там милая и красивая девушка Альфа. Она — робот, её хозяин давно отправился в долгое путешествие и оставил своё кафе Альфе. Иногда он присылает ей весточки и даже посылки. Жизнь Альфы идёт неторопливо и размеренно. Она любит ездить по островку на своём мотороллере, любит своих соседей и немногочисленных посетителей. День за днём она делает кофе, ждёт своего хозяина, и наслаждается красотой мира вокруг......

...

Прошло много лет после событий первого фильма. «9-й Отдел» по-прежнему выполняет свою работу. Киборгизированный полицейский Бато с партнером Тогусой после таинственного исчезновения "Майора" Мотоко Кусанаги назначаются расследовать серию убийств, совершенных прототипами гиноидов, самоуничтожающимися после этого. Но перед самоуничтожением один из таких гиноидов попросил Бато о помощи......

Полнометражный фильм, который является адаптацией первого и второго сезона с альтернативной концовкой, добавлением новых кадров, информации, пояснений....

...

Томоки Сакурай со времён своего детства видит один и тот же странный сон, каждый раз просыпаясь в слезах. Эйсиро Сугата, старшеклассник из его школы, верит, что этот сон — сон о некоем «Новом континенте», парящем в небе. Позже вечером, ожидая под деревьями вишни Сугату с подругой детства — Сохарой Мицуки, Сакурай видит, как ангел спускается на землю с небес. И его мирная жизнь с этого момента меняется навсегда......