Прошло 2 года с того дня, как Мотоко Кусанаги ушла из 9-го отдела. Новым лидером стал Тогуса, расширив штат отдела до 20 оперативных работников. Обновленный состав сталкивается с серией странных случаев, которые выводят их на высококлассного хакера под ником «Кукольник». В разгар расследования Бато сталкивается с Мотоко. Уходя, она говорит лишь держаться подальше от Solid State Society — общества, обеспечивающее стабильность государства. Бато остается лишь гадать, может Мотоко и есть Кукольник?...

Прямое продолжение Драконий жемчуг Кай. История повествует нам о Сон Гоку, младенце с другой планеты. Будучи рожденным, он был отослан на Землю, дабы по мере своего взросления стереть все живое на планете. Травма, полученная в раннем детстве, нарушила генетическую особенность, и программа уничтожения была стерта. Взращённый стариком-отшельником высоко в горах, он и после смерти своего названного отца оставался один в горах. Уже взрослый Сон Гоку женился на красавице Чи-Чи, и у них родился...

...

Эта история происходит в недалёком будущем, где человечество было подвержено атаке разносящими вирус паразитами, именуемыми гастреями. В результате этого, будучи изгнанными из своих родных домов, род людей существует лишь на небольшой территории, где, уже потерявшие всякую надежду, они живут бок о бок со смертью. В этом тёмном мире живёт Рэнтаро, парень, чей дом находится рядом с Токио, состоящий в «Гражданской безопасности» — организации, занимающейся борьбой с теми самыми паразитами...

...

...

...

Потеряв всякую надежду, королева давно обреченной на смерть гигантской замороженной планеты Ла-Метал приказала всем поданным заменить свои тела на механические, чтобы дать им последний шанс на выживание. Но цена новых бессмертных тел оказалась высока — все жители планеты утратили человеческий разум. Превратившись в бездушного робота, Ла Андромеда Прометия II, королева Ла-Метал, решила механизировать все человечество. Дочери королевы, Мэйтэл и Эмеральда, увидев последствия использования...

Прошла тысяча лет с тех пор, как Солнечную систему уничтожила неизвестная раса Гауна. Это гигантские, практически неуязвимые твари, не имеющие разума. Выжившее население Земли сбежало из Солнечной системы на космических кораблях «Сидония», которые позволили сохранить человеческий род. Путешествуя в пространстве и спасаясь от преследования инопланетных существ, люди научились строить пилотируемые механизмы для своей защиты. Вся жизнь Нагатэ Таникадзэ прошла в изоляции на космическом корабле....

При трагических обстоятельствах узнав об истинной природе «Сивиллы», инспектор Аканэ Цунэмори принимает решение подчиниться системе, искренне веря, что в конце концов человечность и правопорядок смогут сосуществовать в гармонии. После дела Сёго Макисимы и исчезновения Синъи Когами суматоха в департаменте утихла, и город вернулся к прежней размеренно управляемой жизни. Инспектор Цунэмори теперь — член нового подразделения полиции, а преследование и задержание преступников для неё отныне...