Чимчар мечтает стать частью гильдии Виглитаффа, поэтому приходит на его базу, где собираются команды исследователей. Но, испугавшись системы безопасности на базе, убегает и натыкается на Пиплапа, который лежит без сознания. Придя в себя, Пиплап не может понять, что происходит и как он оказался в теле покемона, ведь он на самом деле человек. Чимчар предлагает обратиться за помощью к Виглитаффу из гильдии. Однако и тот не может объяснить, как такое произошло, и убеждает Чимчара и Пиплапа...

Мальчик по имени Сатоши отправляется в поездку, чтобы стать мастером покемонов, с его первым покемоном Пикачу. В его путешествии к нему присоединяется Такэши — одержимый девочками горный тренер покемонов, и Касуми — пацанка, водный тренер покемонов, которая, возможно, влюблена в первого. Сатоши с командой проезжают различные области, включая Канто, Оранжевые острова и Дзёто, и затем принимают там участие в «Лиге покемонов». По пути они сталкиваются с обособленной организацией под названием...